Séminaire PhilSci

Environ la moitié du génome humain est composée d'éléments transposables. Ils ont joué un rôle majeur dans l'évolution des génomes des mammifères et de l'homme et sont également connus pour être actifs dans de nombreuses maladies telles que le cancer (Lee et al., 2012). Les éléments transposables sont classés en deux catégories, les rétrotransposons et les transposons à ADN, qui reflètent leur mode de transposition. Les premiers sont composés de répétitions terminales longues (LTR), également appelées rétrovirus endogènes (ERV), et de répétitions non LTR qui comprennent des éléments nucléaires intercalés longs (LINE) et des éléments nucléaires intercalés courts (SINE). Contrairement aux transposons qui utilisent un mécanisme de « couper-coller » pour se déplacer dans le génome, les rétrotransposons utilisent un mécanisme de « copier-coller », qui implique la transcription du rétrotransposon en ARN, suivie de la transcription inverse de l'ARN en ADN, et de l'insertion de la nouvelle copie d'ADN à un nouvel endroit du génome. L'activité de ces éléments dans le génome peut affecter le destin cellulaire et participer à la transformation et à la progression des cellules cancéreuses. Dans cette perspective, j'examine l'impact des rétrotransposons sur l'évolution des cellules cancéreuses. Actuellement, l'évolution des cellules cancéreuses est représentée par le modèle d'évolution clonale. En résumé, les cellules cancéreuses acquièrent des mutations qui sont transmises à leurs descendants, générant une hétérogénéité génétique intratumorale dans l'espace et le temps. Certaines de ces mutations confèrent un avantage sélectif à la cellule mère et à ses descendants, ce qui entraîne une surexpansion du clone (la population de cellules qui descendent de la cellule initiale qui a acquis la mutation) par rapport à d'autres clones de cellules cancéreuses. D'autres mutations sont délétères et entraînent la diminution ou la disparition du clone porteur de ces mutations. La plupart sont neutres et sont simplement transmises par les cellules. Au cours des dernières années, l'intérêt accru pour le modèle d'évolution clonale a conduit à plusieurs améliorations, telles que la reconnaissance de la possibilité d'une évolution neutre (Williams et al., 2016) et une expansion au-delà de la focalisation initiale sur les mutations. Landau et al. (2014) ont par exemple étudié l'évolution clonale épigénétique ; Maley et al. ont souligné l'importance de l'écologie (Maley et al., 2017). Sepich-Poore et al. (Sepich-Poore et al., 2022) ont plaidé en faveur d'une vision multi-espèces de l'évolution clonale en considérant le rôle des bactéries intratumorales. Ces dernières années, il est devenu évident que les éléments transposables peuvent jouer un rôle important dans la transformation et la progression du cancer, mais le rôle des éléments transposables reste à incorporer dans le modèle d'évolution clonale. Dans cette perspective, je montre qu'une telle intégration peut nécessiter quelques ajustements théoriques du modèle d'évolution clonale.